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AR 阳性和 AR 阴性转移性前列腺癌中前列腺特异性膜抗原异质性和调节的概况。发表时间:2023 年 4 月摘要:肿瘤表达前列腺特异性膜抗原 (PSMA) 在 15-20% 的去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 男性中丢失,但其潜在机制仍未明确。在雄激素受体 (AR) 阳性 CRPC 中,我们观察到低……阅读更多 »表观遗传修饰剂α-酮戊二酸调节糖尿病心脏中的异常基因体甲基化和羟甲基化标记。发表时间:2023 年 4 月摘要:背景:糖尿病心肌病 (DCM) 是一种糖尿病患者死亡的主要原因。高血糖心肌微环境显着改变染色质结构和转录组,导致信号异常激活……阅读更多»综合表观基因组分析揭示疾病特异性染色质的程度锡陈述并告知强直性脊柱炎的靶点发现 发表时间:2023 年 4 月摘要:强直性脊柱炎 (AS) 是一种常见的、高度遗传的炎症性关节炎,其特征是脊柱和骶髂关节的附着点炎。全基因组关联研究 (GWAS) 揭示了 100 多个遗传关联,其功能...阅读更多 »Li-Fraumeni 综合征相关二聚体形成突变体 p53 促进反式激活独立线粒体细胞死亡。发表时间:2023 年 4 月摘要:未标记:p53 肿瘤抑制蛋白寡聚化域 (OD) 中的癌症相关突变,与 DNA 结合域中的那些不同,尚未得到很好的阐明。在这里,我们描述了种系 OD 突变体 p53 (A347D),它 oc...阅读更多»哺乳动物组织的空间表观基因组-转录组共同分析。发表时间:2023 年 4 月摘要:新兴的空间技术,包括空间转录组学和空间表观基因组学,正在变得强大profilin工具g 组织环境中的细胞状态。然而,目前的方法仅捕获一层组学信息……阅读更多»胚胎干细胞中 SUMO 化的瞬时抑制产生胚胎样结构。发表时间:2023 年 4 月摘要:合成胚胎学的最新进展为理解复杂事件开辟了新途径控制哺乳动物围着床发育。在这里,我们表明小鼠胚胎干细胞 (ESCs) 仅暴露于化学抑制...阅读更多 »一种基于驱动蛋白的方法诱导人类细胞染色体特异性错误分离。发表时间:2023 年 4 月摘要:各种癌症类型表现特征性和复发性非整倍体模式。这些癌症类型特异性核型的起源仍然未知,部分原因是在人类细胞中引入或消除特定染色体仍然构成挑战……阅读更多»Farrerol 直接激活去泛素酶 UCHL3 以促进 DNA 修复和重新编程 when mediated by somatic cell nuclear transfer. Published: April, 2023Abstract: Farrerol, a natural flavanone, promotes homologous recombination (HR) repair to improve genome-editing efficiency, 但 farrerol 直接靶向调节 HR 修复的特定蛋白质及其潜在的分子机制有没有……阅读更多 »精子 DNA 甲基化在长期培养的精原干细胞移植后出生的小鼠后代中主要是稳定的。发表时间:2023 年 4 月摘要:背景:精原干细胞移植 (SSCT) 被提议作为儿童的生育治疗癌症幸存者。 SSCT 从在性腺毒性治疗(例如癌症治疗)之前冷冻保存睾丸活检开始。当 ...阅读更多 »二甲双胍和碳水化合物控制饮食对多囊卵巢综合征女性子宫内膜 DNA 甲基化和基因表达的影响。发表时间:2023 年 4 月摘要:多囊卵巢综合征 (PCOS) 是一种育龄妇女与不孕症和代谢紊乱相关的内分泌疾病。在这项研究中,我们评估了与子宫内膜功能相关的八个基因的表达及其 DNA 甲基……阅读更多»猿猴免疫缺陷病毒 (SIV) 感染和 SIV 相关中枢神经系统病理学中脑组织和脑组织衍生的细胞外囊泡的 RNA 景观。发表时间:2023 年 4 月摘要:抗逆转录病毒治疗方案可以有效控制 HIV 复制和疾病进展的某些方面。然而,尚未完全了解中枢神经系统 (CNS) 疾病等终末器官疾病的分子事件,并且常规……阅读更多»EZH2 的独特调节及其在多瘤病毒阳性和阴性 Merkel 细胞癌中的抑制性 H3K27me3 标记。已发布: 2023 年 4 月摘要:Merkel 细胞癌 (MCC) 是一种侵袭性皮肤癌,Merkel 细胞多瘤病毒 (MCPyV) 整合并表达少量的病毒性癌基因T 和大 T 已被确定为主要的致癌决定因素。最近,th 的一个组成部分……阅读更多 » Biomphalaria pfeifferi 的基因组序列,这是人类感染寄生虫 Schistosoma mansoni 的主要载体蜗牛。发布时间:2023 年 3 月摘要:背景:Biomphalaria pfeifferi 是世界上分布最广且通常牵连的载体蜗牛种为人类肠道血吸虫病的病原体曼氏血吸虫。 Inefforts to control S. mansoni transmission,...阅读更多 »石灰斑点哈巴狗的基因组序列,Eupithecia centaureata(Denis & SchiffermuÌ^ller, 1775)发布时间:2023 年 3 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Eupitheciacentaureata 的基因组组装(石灰斑哈巴狗;节肢动物;昆虫;鳞翅目;尺蠖科)。基因组序列跨度为 465.6 兆碱基。大多数程序集被搭建成 32 条染色体……阅读更多»早期大黄蜂的基因组序列,Bombus pratorum(林奈,1761) 发布时间:2023 年 3 月摘要:我们展示了来自个体雌性熊蜂(早期大黄蜂;节肢动物;昆虫纲;膜翅目;蜂科)的基因组组装。基因组序列跨度为 285.1 兆碱基。大多数程序集被搭建成 18 条染色体假单胞菌……阅读更多»金尾叶行者 Xylotasylvarum 的基因组序列(林奈,1758 年)发表时间:2023 年 3 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Xylota sylvarum(the金尾叶行者;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;食蚜蝇科)。基因组序列跨度为 534.8 兆碱基。大多数程序集都被搭建成五个染色体……阅读更多»小草原鸡(Tympanuchus pallidicinctus)的高度连续和注释的基因组组装。发表时间:2023 年 3 月摘要:小草原鸡(Tympanuchus pallidicinctus;LEPC)是一种标志性的北美草原松鸡,以华丽壮观的繁殖季节展示而闻名。很遗憾,该物种在其大部分历史范围内已经消失,...阅读更多»红宝石虎的基因组序列,Phragmatobia fuliginosa(林奈,1758 年)发布时间:2023 年 3 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Phragmatobiafuliginosa(红宝石虎)的基因组组装;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;鹤科)。基因组序列跨度为 629.4 兆碱基。大多数程序集被搭建成 28 条染色体假...阅读更多»白肩大理石的基因组序列,Apotomisturbidana(Hübner,1825 年)发表时间:2023 年 3 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Apotomisturbidana(白色-肩纹大理石;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;蛛科)。基因组序列跨度为 720.5 兆碱基。大多数程序集被搭建成 28 个染色体……阅读更多»使用单个标本的长读长测序,绘制了禽虱 Brueelia nebulosa 及其相关人员的基因组程序集草图。发布时间:2023 年 2 月摘要:使用长读长和连锁阅读技术对高分子量 (HMW) DNA 进行测序,促进了非模式生物的更完整基因组序列的大幅增加。依赖 HMW DNA 的测序方法仅限于更大的……阅读更多 »灰貂 Yponomeuta sedella 的基因组序列(Treitschke,1832 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Yponomeuta sedella 的基因组组装(灰貂;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;Yponomeutidae)。基因组序列跨度为 658 兆碱基。大多数程序集被搭建成 31 条假染色体……阅读更多»鼠蛾 Amphipyra tragopoginis 的基因组序列(Clerck 1759)发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Amphipyratragopoginis(鼠蛾;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 806 兆碱基。大多数程序集被搭建成 31 条假染色体……阅读更多 »The Miller, Acronicta leporina (Linnaeus, 1758) 的基因组序列发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雌性 Acronictaleporina(米勒;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)的基因组组装。基因组序列跨度为 466 兆碱基。大部分组装都被搭建成 32 条染色体假分子……阅读更多 »士兵甲虫 Podabrus alpinus (Paykull, 1798) 的基因组序列发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了一只雌性 Podabrus alpinus(士兵甲虫)的基因组组装;节肢动物门;昆虫门;鞘翅目;斑蝥科)。基因组序列跨度为 777 兆碱基。大部分组装被组装成七个染色体假体……阅读更多»杀死甲虫的黄蜂 Tiphia femorata 的基因组序列(Fabricius,1775 年)发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Tiphia femorata 的基因组组装(杀甲虫的黄蜂; 节肢动物门; 昆虫门; 膜翅目; Tiphilidae).基因组序列跨度为 276 兆碱基。大多数程序集 (98.73%) 被搭建成 12 个染色体……阅读更多 »The genome sequence of the Green-brindled Crescent, Allophyesoxyacanthae (Linnaeus, 1758)Published: February, 2023Abstract: We present a genome assembly from a individual male Allophyesoxyacanthae(绿斑纹新月体;节肢动物门;昆虫门;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 458 兆碱基。整个组件被搭建成 31 条染色体……阅读更多 »乡村肩结的基因组序列,Apamea sordens(Hufnagel,1766)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Apameasordens(Rustic肩节纲;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 614 兆碱基。 Thewhole assembly is scaffolded into 31 chromosomalpseudom...Read more »Thecocarcelia acutangulata (Macquart, 1850)Published: February, 2023Abstract:我们展示了来自单个雌性 Thecocarceliaacutangulata(节肢动物门;节肢动物门;昆虫门;双翅目;节肢动物科)的基因组组装。基因组序列跨度为 693 兆碱基。大部分组装都被搭建成六个染色体 pse...阅读更多»单分子 DNA 测序揭示的单链错配和损伤模式。发布时间:2023 年 2 月摘要:突变在整个生命过程中积累在身体每个细胞的基因组中,导致癌症和其他遗传病。几乎所有这些马赛克突变都开始于 DNA prio 两条链中的一条中的核苷酸不匹配或损坏......阅读更多 »普通蓝的基因组序列,Polyommatus icarus(Rottemburg,1775)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们提出来自个体雄性 Polyommatus icarus(普通蓝;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;灰蝶科)的基因组组装。基因组序列跨度为 512 兆碱基。大部分组装都被搭建成 23 条染色体 pseudomol...阅读更多 »常见绿色 Tenthredo、Tenthredo mesomela 的基因组序列(Linnaeus,1758)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雌性 Tenthredomela(常见的绿色 Tenthredo;节肢动物;昆虫纲;膜翅目)的基因组组装; Tenthredinidae)。基因组序列跨度为 393 兆碱基。大部分组件被搭建成 10 个 chro...阅读更多»加州鹌鹑 (Callipepla californica) 的高度连续基因组组装。发布时间:2023 年 2 月摘要:加州鹌鹑 (Callipepla californica) 是灌木丛和橡树的标志性本土鸟类加利福尼亚州和墨西哥巴哈半岛的林地。在这里,我们报告了从 PacBio HiFi 长读和 O... 生成的物种的草图参考组装...阅读更多»鸟丽蝇的基因组序列,Protocalliphora azurea(Fallén,1817 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了一个基因组组装来自个体雄性 Protocalliphoraazurea(一种鸟丽蝇;艺术陆足目;昆虫纲;双翅目;丽蝇科)。基因组序列跨度为 874 兆碱基。大多数程序集被搭建成七个染色体假...阅读更多»小黄蜂的基因组序列,Volucellainanis(林奈,1758 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Volucella inanis(较小的黄蜂食蚜蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;食蚜蝇科)。基因组序列跨度为 961 兆碱基。大部分组装都被搭建成六个染色体 ps...阅读更多»鱼黄蜂 Amblyteles armatorius 的基因组序列(福斯特,1771 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Amblytelesarmatorius(一种鱼黄蜂)的基因组组装;节肢动物;昆虫纲;膜翅目;鱼科)。基因组序列跨度为 216 兆碱基。大多数程序集被搭建成 12 条染色体……阅读更多»抛光黄铜的基因组序列,Diachrysia chrysitis(Linnaeus, 1758) 发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了个体雄性 Diachrysiachrysitis(抛光黄铜;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)的基因组组装。基因组序列跨度为 386 兆碱基。大部分组装都被组装成 31 条染色体假...阅读更多»梭形飞镖 Agrotis puta 的基因组序列(Hübner,1803 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Agrotis puta 的基因组组装( theShuttle-shaped Dart;Arthropoda;Insecta;Lepidoptera;Noctuidae)。基因组序列跨度为 522 兆碱基。大部分组装都被搭建成 31 条染色体假单胞菌……阅读更多 »森林杜鹃蜂 Bombus sylvestris 的基因组序列(Lepeletier,1832 年)发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Bombus sylvestris(the林杜鹃蜂;节肢动物门;昆虫纲;膜翅目;蜜蜂科)。基因组序列跨度为 303 兆碱基。大部分组装脚手架成 24 条染色体假单胞菌...阅读更多 »黑暗拱门 Apamea monoglypha 的基因组序列(Hufnagel,1766)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Apamea monoglypha(黑暗拱门,节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为576兆碱基。大部分组装被组装成 31 条染色体假分子……阅读更多 »小星海葵 Nematostella vectensis(斯蒂芬森,1935 年)的基因组序列发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个 Nematostella vectensis(小星)的基因组组装海葵;刺胞动物门;珊瑚虫纲;海葵属;爱德华科)。基因组序列跨度为 269.4 兆碱基。大多数程序集被搭建成 15 条染色体 ...阅读更多 »较小的肉蝇 Sarcophaga (Sarcophaga) subvicina (Baranov, 1937) 的基因组序列发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体的基因组组装l 雄性Sarcophagasubvicina(小虫肉蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;麻蝇科)。基因组序列跨度为 71 兆碱基。大部分组装 (95.91%) 被搭建成六个……阅读更多 »T 毒素毒力基因:重复海洋中不相连的点发布时间:2023 年 2 月摘要:1970 年,南方玉米叶枯病疫情肆虐美国农田,给经济带来巨大损失损失。爆发是由真菌 Cochliobolusheterostrophus 的前所未见、毒性超强的 Race T 引起的。 Race T 和 ... 阅读更多»桦木大理石 Apotomis betuletana 的基因组序列(Haworth,1811 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Apotomisbetuletana(桦木大理石;节肢动物)的基因组组装;昆虫纲;鳞翅目;蛛科)。基因组序列跨度为 684 兆碱基。大多数程序集被搭建成 28 条假染色体……阅读更多 »肉桂莎草石蚕的基因组序列fly, Limnephilusmarmoratus (Curtis, 1834) 发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个 Limnephilus marmoratus(石蛾;节肢动物门;昆虫纲;毛翅目;Limnephilidae)的基因组组装。基因组序列跨度为 1,630 兆碱基。大多数程序集 (99.93%) 被搭建成 30 条染色体...阅读更多 »花斑食蚜蝇 Scaeva pyrastri (Linnaeus, 1758) 的基因组序列发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性的基因组组装Scaeva pyrastri(花斑食蚜蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;食蚜蝇科)。基因组序列跨度为 320 兆碱基。大部分组装被组装成四个染色体假分子……阅读更多 »野外杜鹃蜂 Bombus campestris 的基因组序列(Panzer,1801)发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Bombus campestris 的基因组组装(杜鹃蜂;节肢动物门;昆虫纲;膜翅目;蜜蜂科)。基因组序列在 sp 中为 275 兆碱基一个。大部分组装都被搭建成 25 条染色体假分子……阅读更多»大船长 Ochlodes sylvanus 的基因组序列(Esper,1777 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Ochlodessylvanus 的基因组组装,大船长(节肢动物门;昆虫门;鳞翅目;赫斯佩里达科)。基因组序列跨度为 380 兆碱基。大多数程序集 (99.97%) 被支架成 30 个染色体...阅读更多»皇冠的基因组序列,Craniophora ligustri(Denis 和 Schiffermüller,1775 年)发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雌性 Craniophoraligustri 的基因组组装(冠冕;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 438 兆碱基。 wholeassembly is scaffolded into 32 chromosomal pseudomolecu...阅读更多»疟疾蚊子的染色体参考基因组序列,冈比亚按蚊,贾尔斯,1902 年,Ifakara 菌株发布时间:2023 年 2 月摘要:我们预从单个雌性冈比亚按蚊(疟疾蚊子;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;蚊科)Ifakara 菌株进行基因组组装。基因组序列跨度为 264 兆碱基。大部分组件被搭建成三个 c...阅读更多»棕色扇贝 Philereme vetulata 的基因组序列(Denis 和 Schiffermüller,1775 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雌性 Phileremevetulata(the褐扇贝;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;尺蠖科)。基因组序列跨度为 771 兆碱基。大多数程序集被搭建成 68 条染色体假...阅读更多»苍白 Rhogogaster 的基因组序列,Rhogogaster chlorosoma(Benson,1943 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Rhogogasterchlorosoma(苍白 Rhogogaster chlorosoma)的基因组组装; 节肢动物门; 昆虫纲; 膜翅目; 十翅目昆虫纲)。基因组序列跨度为 255 兆碱基。整个组件被搭建成 10 个chromoso...阅读更多 »黄貂的基因组序列,Spilarctia lutea(Hufnagel,1766)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雌性黄貂(Buff Ermine;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;; Erebidae)。基因组序列跨度为584.8兆碱基。大多数程序集都被组装成 32 条染色体假分子……阅读更多 »蓝瓶花的基因组序列,Calliphora vomitoria(林奈,1758 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Calliphoravomitoria(蓝瓶花;节肢动物门)的基因组组装;昆虫纲;双翅目;丽蝇科)。基因组序列跨度为 708 兆碱基。大多数程序集被搭建成六个染色体假分子……阅读更多»豹蛾 Zeuzera pyrina 的基因组序列(林奈,1761 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Zeuzera pyrina(豹)的基因组组装蛾,节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;Cossidae).基因组序列跨度为687兆碱基。大部分组装被组装成 31 个染色体假分子……阅读更多»黄线贵格会 Agrochola macilenta 的基因组序列(Hubner,1809)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Agrocholamacilenta(the黄线贵格会;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 683 兆碱基。大多数程序集被搭建成 32 条染色体……阅读更多»双斑羽的基因组序列,Stenopliabipunctidactyla(Scopoli,1763 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Stenoptiliabipunctidactyla(双胞胎)的基因组组装-斑羽;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;翼龙科)。基因组序列跨度为 822.9 兆碱基。大部分组件都被搭建成 30 个字符……阅读更多»普通吻飞蝇的基因组序列,Rhingiacampestris(梅根,1822 年)发布时间:2 月ruary, 2023 摘要:我们展示了一个来自单个雄性油菜林蛙(Common Snout Hoverfly;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;食蚜蝇科)的基因组组装。基因组序列跨度为 720 兆碱基。大部分组装被搭建成五个染色体 ps...阅读更多»斑驳莎草 Glyphotaelius pellucidus 的基因组序列(Retzius,1783 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Glyphotaeliuspellucidus(斑驳莎草,Mottled Sedge,节肢动物门;昆虫纲;毛翅目;Limnephilidae)。基因组序列跨度为 1,037.1 兆碱基。大部分组装被支架成 30 条染色体...阅读更多 »The genome sequence of the Small Ranunculus, Hecatera dysodea (Denis & SchiffermuÌ^ller, 1775)Published: February, 2023Abstract: We present来自个体雌性 Hecatera dysodea(小毛茛属;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)的基因组组装。基因组序列跨度为 640.9 兆碱基。大多数屁股mbly 被搭建成 32 条染色体 pse...阅读更多 »普通羽蛾 Emmelina monodactyla 的基因组序列(Linnaeus,1758)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Emmelinamononodactyla(普通羽毛;节肢动物)的基因组组装;昆虫纲;鳞翅目;翼翅目)。基因组序列在跨度内为 312 兆碱基。大部分装配被支架成 30chromosomalp...阅读更多 »脊椎动物性染色体的不完全转录剂量补偿通过转录后补偿来平衡发布时间:2023 年 2 月摘要:存在异形性染色体(XY 或 ZW)两性之间和常染色体的基因不平衡问题。长期以来,哺乳动物的 X 染色体失活被认为意味着脊椎动物对剂量补偿的迫切需要。如何...阅读更多 »沼泽黄芩 (Scutellaria galericulataL) 的基因组序列。发布时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自n 个体 Scutellariagalericulata(沼泽黄芩;链藻门;Magnoliopsida;唇形目;唇形科)。基因组序列跨度为 328 兆碱基。大部分组装被支架成 15 个染色体 p...阅读更多 »果酱飞蛾的基因组序列,Episyrphus balteatus(De Geer,1776 年)发布时间:2023 年 2 月摘要:我们提出了一个来自个体雌性 Episyrphusbalteatus(果酱食蚜蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;食蚜蝇科)的基因组组装。基因组序列跨度为 535 兆碱基。大部分组装都被支架成五个染色体 p...阅读更多»螃蟹黑客藤壶的基因组序列,Sacculina carcini(汤普森,1836 年)发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Sacculinacarcini(螃蟹黑客)的基因组组装藤壶;节肢动物;甲壳纲;Thecostraca;Sacculinidae)。基因组序列跨度为 264 兆碱基。大多数组件都被搭建成 28 条染色体……阅读更多 »分阶段的 nanopore assembly with Shasta 和 modular graph phasing with GFAse 发布时间:2023 年 2 月摘要:作为简化和降低单倍型解析从头组装成本的一步,我们描述了使用 Shasta 基因组组装器和用于将定相扩展到染色体 sc...阅读更多 »MYC 驱动的线粒体 DNA 拷贝数增加发生在早期,并在整个前列腺癌进展过程中持续存在发表时间:2023 年 2 月摘要:增加的线粒体功能可能使一些癌症易受线粒体抑制剂的影响。由于线粒体功能部分受线粒体 DNA 拷贝数 (mtDNAcn) 调节,mtDNAcn 的准确测量可以帮助揭示哪些……阅读更多 »黑针蝇 Leuctra nigra (Olivier,1811) 的基因组序列发表时间:2023 年 2 月摘要:我们展示来自个体雄性 Leuctra nigra(黑针蝇;节肢动物;昆虫纲;多旋翼昆虫)的基因组组装A; Leuctridae).基因组序列跨度为536.3兆碱基。大多数程序集被组装成 13 个染色体假分子……阅读更多»Riband Wave 的基因组序列,Idaea aversata(林奈,1758 年)发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Idaea aversata(Riband波;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;尺蠖科)。基因组序列跨度为 437 兆碱基。 wholeassembly 被搭建成 30 个染色体假分子...阅读更多»The genome sequence of the Brick, Agrochola circellaris (Hufnagel, 1766)Published: January, 2023Abstract: 我们展示了来自单个雄性 Agrocholacircellaris(砖;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 572 兆碱基。大部分组装都被搭建成 30 个染色体假分子……阅读更多 »Roselle 的肉蝇 Sarcophaga (Helicophagella) rosellei 的基因组(Böttcher,1912 年)发表时间:2023 年 1 月摘要ract:我们展示了来自个体雄性 Sarcophagarosellei(玫瑰茄的肉蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;Sarcophagidae)的基因组组装。基因组序列跨度为 541 兆碱基。大多数程序集被搭建成六个染色体假...阅读更多»常见绿色沟蜂 Lasioglossum morio 的基因组序列(Fabricius,1793)发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Lasioglossum morio 的基因组组装(普通绿沟蜂;节肢动物门;昆虫纲;膜翅目;蜂科)。基因组序列跨度为 547 兆碱基。超过一半的程序集 (55.79%) 被支架在……阅读更多»石蛾 Limnephilus lunatus (Curtis, 1834) 的基因组序列发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自个体 Limnephilus lunatus (acaddisfly) 的基因组组装;节肢动物门;昆虫纲;毛翅目;林蝇科)。基因组序列跨度为 1,270 兆碱基。大部分装配被组装成 13 条染色体假分子cu...阅读更多 »直立苔藓虫 Bugulina stolonifera 的基因组序列(Ryland,1960)发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了 Bugulina stolonifera 菌落的基因组组装(anerect bryozoan; Bryozoa; Gymnolaemata; Cheilostomatida; Bugulidae) .基因组序列跨度为235兆碱基。大多数程序集 (99.85%) 被搭建成 11 条染色体 ...阅读更多 »二态熊食蚜蝇的基因组序列,Criorhinaberberina (Fabricius, 1805) 发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自个体雌性的基因组组装Criorhinaberberina(二态熊食蚜蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;食蚜蝇科)。基因组序列跨度为 410 兆碱基。大部分装配 (99.72%) 被支架成四个...阅读更多 »杂交葡萄葡萄 \'Chambourcin\' 的基因组装配发布时间:2023 年 1 月摘要:背景 \'Chambourcin\' 是一种生长在美国东部和中西部的法美种间杂交葡萄品种atesand 用于酿造葡萄酒。目前,很少有基因组资源可用于像 \'Chambourc 这样的杂交葡萄树......阅读更多 »杀蜗牛苍蝇的基因组序列,Pherbina coryleti(Scopoli,1763)发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自个体的基因组组装雄性Pherbina coryleti(食螺蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;Sciomyzidae)。基因组序列跨度为863兆碱基。大多数程序集都被组装成六个染色体假分子……阅读更多»花斑锦葵的基因组序列,Ypsolopha 后遗症(Clerck,1759)发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自单个 Ypsolopha 后遗症(thePied Smudge;节肢动物门;昆虫门;鳞翅目;叶蜂科)。基因组序列跨度为 867 兆碱基。大多数程序集被组装成 30 个染色体假分子……阅读更多 »分段蠕虫 Sthenelais limicola(Ehlers,1864 年)的基因组序列发表时间:2023 年 1 月摘要:我们预从单个 Sthenelais limicola(分段蠕虫;环节动物;多毛类;Phyllodocida;Sigalionidae)进行基因组组装。基因组序列跨度为 1,131 兆碱基。大多数程序集被搭建成九条染色体 ps...阅读更多»海垫的基因组序列,Membranipora membranacea(林奈,1767 年)发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自 Membraniporamembranacea(海洋)成年菌落的基因组组装垫;苔藓虫;Gymnolaemata;Cheilostomatida;Membraniporidae)。基因组序列跨度为 339 兆碱基。大多数组装 (99.95%) 被支架成 1...阅读更多»使用 UHPLC-Q-Tof MS/MS 对产生γ-氨基丁酸的 PsychobioticLimosilactobacillus reuteri 及其非靶向代谢组学进行全基因组分析。发表时间:2023 年 1 月摘要:The γ-氨基丁酸 (GABA) 是一种化学信使,对大脑和肌肉的健康至关重要。一些乳酸菌 (LAB) 具有发挥作用的潜力s psychobiotic culturesbecause they can produce significant amou...阅读更多»濒危大锤头鲨和短鳍灰鲭鲨的基因组揭示了大锤头鲨的历史性种群数量下降和高水平近亲繁殖。发表时间:2023 年 1 月摘要:尽管 Elasmobranchii(鲨鱼和鳐鱼)的灭绝威胁越来越大),缺乏基于全基因组的保护见解。在这里,我们展示了极度濒危的大双髻鲨 () 和 Endan 的染色体级基因组组装……阅读更多 »使用完整的叶绿体基因组作为潜在有效的超级条形码鉴定 Laportea bulbifera。发布时间:2023 年 1 月摘要:Laportea bulbifera,a生长在喀斯特地区的苗药,对老年人皮肤瘙痒有独特的疗效,年销售额>>亿元。由于 L 的资源短缺和 largemorphological variations ...阅读更多»全基因组揭示进化关系和机甲nismsNeodiprion Sawflies 的潜在基因树不一致发布时间:2023 年 1 月摘要:快速进化的分类群是理解产生生物多样性的机制的绝佳模型。然而,开发一个准确的历史框架来比较分析这些谱系仍然是一个挑战,因为无处不在……阅读更多»白条金的基因组序列,Micropterix aruncella(Scopoli,1763)发布时间:2023 年 1 月摘要:我们提出了一个来自个体雌性 Micropterixaruncella(White-barred Gold;节肢动物门、昆虫门、鳞翅目;Micropterigidae)的基因组组装。基因组序列跨度为 1,079 兆碱基。大多数程序集被搭建成 31 个 chr...阅读更多»暗鞍 leucozona 的基因组序列,Leucozona laternaria(穆勒,1776 年)发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Leucozonaternaria(the dark-saddled leucozona; 节肢动物门; 昆虫纲; 双翅目; 食蚜蝇科).基因组序列跨度为 614 兆碱基。大部分组装 (99.69%) 被搭建成五个……阅读更多»斑点万花筒水母 Haliclystusoctoradiatus 的基因组序列(James-Clark,1863 年)发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自单个 Haliclystusoctoradiatus 的基因组组装(斑点万花筒水母;刺胞动物门;星形动物门;星形水母科;Haliclystidae)。基因组序列跨度为 262 兆碱基。大多数程序集 (98.3%) 是 scaffo...阅读更多 » ichneumon 黄蜂 Buathra 实验室的基因组序列(Thunberg,1822)发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自单个 Buathra 实验室(节肢动物;节肢动物;昆虫纲;膜翅目;蜂科)。基因组序列跨度为 330 兆碱基。超过 60% 的组装被组装成 11 个染色体假分子。 mit...阅读更多»金三角的基因组序列,Hypsopygia costalis(Fabricius,1775)发布:2023 年 1 月Abstract:我们展示了来自单个雄性 Hypsopygiacostalis(金三角;节肢动物门;昆虫门;鳞翅目;蜻蜓科)的基因组组装。基因组序列跨度为 818 兆碱基。大部分组装都被搭建成 31 条染色体假体……阅读更多»地面甲虫 Nebria brevicollis(Fabricius,1792)的基因组序列发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Nebriabrevicollis(地面甲虫)的基因组组装;节肢动物;昆虫纲;鞘翅目;步甲科)。基因组序列跨度为 242 兆碱基。大多数程序集被搭建成 15 条染色体假分子……阅读更多»花彩的基因组序列,Apoda limacodes (Hufnagel,1766) 发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Apoda limacodes(Festoon;节肢动物门;昆虫门;鳞翅目;利马科科)。基因组序列跨度为 800 兆碱基。大部分组装被组装成 25 个染色体假分子...阅读更多» 长角扁平体 Carcina quercana(Fabricius,1775)的基因组序列发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自个体雄性 Carcina quercana(长角扁平体;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;Depressariidae)。基因组序列跨度为 409 兆碱基。大多数程序集 (99.96%) 被搭建成 30 个……阅读更多»蓝色肉蝇 Sarcophaga (Robineauella) caerulescens (Zetterstedt, 1838) 的基因组序列发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了一个来自个体雄性 Sarcophagaerulescens(蓝色肉蝇;节肢动物门;昆虫纲;双翅目;麻蝇科)。基因组序列跨度为 597 兆碱基。大多数程序集被搭建成七条染色体……阅读更多»宏基因组组装基因组的扩展目录揭示了马的抗性特征和运动表现相关微生物。发表时间:2023 年 1 月摘要:背景:作为驯化物种马对人类至关重要,在世界范围内饲养,作为运动、休闲、食品生产和运输的机械能来源。 The gut microbiota plays an importrole in the health, diseases, athle...阅读更多 »人类基因组的可扩展纳米孔测序提供了单倍型解析变异和甲基化的综合视图。发表时间:2023 年 1 月摘要:长读长测序技术大大克服了短读的局限性,但由于成本太高、可扩展性不够或太容易出错,迄今为止还没有被认为是可行的大规模替代。她……阅读更多 »用于家燕种群基因组学的染色体水平参考基因组和泛基因组。发布时间:2023 年 1 月摘要:由于缺乏高精度、完整性和连续性的参考基因组,对非模式生物进化的洞察受到限制.在这里,我们提出了一个染色体水平的、核型验证的参考基因组和泛基因组谷仓 sw...阅读更多 »我们所有人的长读长测序的实用程序发布时间:2023 年 1 月摘要:我们所有人 (AoU) 计划旨在对来自不同种族背景的超过一百万美国人的基因组进行测序,以改善个性化医疗服务。在最近的技术试验中,我们比较了传统短读序列的性能……阅读更多»拟南芥拟南芥的基因组序列(Heynh.,1842)发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了拟南芥的基因组组装拟南芥标本(拟南芥;链藻门;木兰藻目;芸苔目;十字花科)。基因组序列跨越 138 兆碱基。大多数程序集 (98.76%) 被搭建成五个染色体 pse...阅读更多»普通黑蜂的基因组序列,Stelis phaeoptera (Kirby,1802) 发布时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了一个来自个体雌性 Stelisphaeoptera(普通黑蜂;节肢动物门;昆虫纲;膜翅目;巨蜂科)。基因组序列是跨度 301 兆碱基。大多数程序集被搭建成 17 条染色体……阅读更多»头巾顶壳 Gibbula magus 的基因组序列(林奈,1758 年)发表时间:2023 年 1 月摘要:我们展示了来自单个 Gibbula magus(头巾顶壳)的基因组组装; 软体动物; 腹足纲; 蛱蝶类; 蛴螬科)。基因组序列跨度为 1,470 兆碱基。大部分组装被组装成 18 个染色体假分子……阅读更多»肯特黑拱门 Meganola albula 的基因组序列(Denis & Schiffermüller,1775 年)发布时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Meganola 的基因组组装albula(肯特黑拱门;节肢动物门;昆虫门;鳞翅目;蛱蝶科)。基因组序列跨度为 405 兆碱基。大多数组装 (99.95%) 被支架成 30 条染色体...阅读更多 »斑点蜂蝇的基因组序列,Bombylius discolor (Mikan,1796) 发布时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了一个基因组来自单个雌性 Bombyliusdiscolor(点状蜂蝇;节肢动物;昆虫纲;双翅目;Bombyliidae)的集合。基因组序列跨度为 280 兆碱基。大部分组装 (99.93%) 被支架化为六条染色体...阅读更多 »银镶蓝斑鱼的基因组序列,Plebejus argus(林奈,1758 年)发表时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Plebejus argus(银镶蓝;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;灰蝶科)的基因组组装。基因组序列跨度为 382 兆碱基。整个组件 (100%) 被搭建成 23 条染色体 ps...阅读更多 »洞穴织布工的基因组序列,Meta bourneti(西蒙,1922 年)发布时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自个体的基因组组装雄性 Meta bourneti(洞穴织布工;节肢动物门;蛛形纲;蛛形纲;四颚科)。基因组序列的跨度为 1,383 兆碱基。大部分组装被组装成 13 个染色体假体……阅读更多 »The genome seque六翼天使 Lobophora halterata 的基因组 (Hufnagel,1767) 发布时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Lobophorahalterata(六翼天使;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;尺翅目)的基因组组装。基因组序列跨度为 315 兆碱基。 Thecomplete assembly is scaffolded into 32chromosomalpseudom...阅读更多»鳞虫 Lepidonotus clava (Montagu, 1808) 的基因组序列发布时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了单个 Lepidonotus clava(鳞虫;环节动物;多毛类)的基因组组装; Phyllodocida; Polynoidae)。基因组序列跨度为 1,044 兆碱基。大部分组装被组装成 18 个染色体假分子....阅读更多»早期灰色 Xylocampa 乳晕的基因组序列(Esper,1789)发表时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自单个 Xylocampa 乳晕(早期灰色)的基因组组装;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)。基因组序列跨度为 565 兆碱基。最多组装的支架被折叠成 31 个染色体假分子,我……阅读更多»北部褐海鱼 Aricia artaxerxes 的基因组序列(Fabricius,1793 年)发表时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自单个 Aricia artaxerxes(thenorthern)的基因组组装brown argus; 节肢动物门; 昆虫纲; 鳞翅目; 狼蛛科)。基因组序列跨度为 458 兆碱基。大部分装配 (99.99%) 被搭建成 23 条染色体……阅读更多 »使用 RagTag 的自动装配脚手架提升了一个新的番茄系统,用于高通量基因组编辑。发布时间:2022 年 12 月摘要:推进作物基因组学需要高效的遗传系统,通过高-高质量的个性化基因组组装。在这里,我们介绍了 RagTag,一种用于自动化组装脚手架和修补的工具集,我们建立了染色体规模的参考 g...阅读更多»使用多种测序技术对癌症参考细胞系样本进行结构变异分析。发布时间:12 月, 2022 摘要: 背景:癌症基因组通常会发生数以千计的结构重排,包括插入、缺失、易位、倒位、重复和拷贝数变异。因此,structuralvariant (SV) 表征发挥...阅读更多»物种特异性碱基调用提高了植物纳米孔测序的实际准确性。发表时间:2022 年 12 月摘要:背景:OxfordNanopore Technologies (ONT) 提供的长读长测序平台允许含有天然 DNA表观遗传修饰直接测序,但可能受到较低的每碱基精度的限制。后测序的一个关键步骤是……阅读更多»小高音蛾 Aplocera efformata(Guenée,1857 年)的基因组序列发表时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Aploceraefformata(小高音)的基因组组装-bar;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;尺蠖科)。基因组序列跨度为349.5兆碱基。大部分组装(99.97%) 脚手架成 32...阅读更多 »从 Cornaceae 科的第一个基因组序列中对 Asterids 的核型进化的见解。发表时间:2022 年 12 月摘要:Cornaceae 是 Cornales 中的核心代表科,是 Asterids 中最早的生命分支谱系被子植物树。该科包括唯一的山茱萸属,约有 55 个物种。这些物种广泛存在于北半球……阅读更多»常见草单板 Agriphila tristella 的基因组序列(Denis & Schiffermüller,1775)发布时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自单个雄性 Agriphilatristella(the普通草单板;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;海螯虾科)。基因组序列跨度为 802 兆碱基。大部分组装 (99.83%) 被搭建成 23 个字符……阅读更多 »高褐贝母 Fabriciana adippe 的基因组序列(Dennis & Schiffermüller, 1775)发布时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了一个基因组来自单个雌性 Fabricianaadippe(高褐贝母;节肢动物;昆虫纲;鳞翅目;蛱蝶科)的组装。基因组序列跨度为 485 兆碱基。大多数程序集 (99.98%) 被搭建成 29...阅读更多»常见小型采矿蜜蜂 Andrena minutula 的基因组序列(Kirby,1802 年)发表时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自单个雌性的基因组程序集Andrena minutula(普通小型矿蜂;节肢动物门;昆虫纲;膜翅目;Andrenidae)。基因组序列跨度为 380 兆碱基。大多数程序集 (92.19%) 被搭建成 sev...阅读更多 »白色海军上将 Limenitis camilla 的基因组序列(林奈,1764 年)发表时间:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自个体雌性 Limenitiscamilla 的基因组组装(白海军上将;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;蛱蝶科)。基因组序列跨度为 435 兆碱基。大多数组件 (99.97%) 被搭建成 31 个染色体……阅读更多 »Th苹果的基因组序列,Malus domestica (Suckow)Borkh.,1803 年发布日期:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自四种 Malus domestica 栽培品种(苹果;Streptophyta;Magnoliopsida;Rosales;蔷薇科)的基因组序列。基因组序列跨度为 643–653 兆碱基。每个装配长度的大部分 (99.24–99.74%) 是脚手架……阅读更多 »欧洲海棠的基因组序列,Malussylvestris (L.) Mill.,1768 发布:2022 年 12 月摘要:我们展示了来自单个海棠(欧洲或\"野生”海棠;链藻门;木兰科;蔷薇科;蔷薇科)。基因组序列跨度为 642 兆碱基。大部分组装 (99.98%) 被搭建成 1...阅读更多 »通过过滤与泛基因组 k-mer 集匹配的外读来超快预测体细胞结构变异。发布时间:12 月, 2022 摘要:变异检测者通常会为结构变异产生大量误报,例如癌症-基因组重排导致的相关拷贝数改变和融合基因。在这里,我们描述了一种超快速和准确的检测方法……阅读更多»膳食蛋氨酸饥饿会损害急性髓性白血病的进展。发表时间:2022 年 11 月摘要:靶向改变的肿瘤细胞代谢可能为急性髓性白血病 (AML) 患者提供一个有吸引力的机会。原发性白血病干细胞和祖细胞群的氨基酸缺失筛选显示许多氨基酸……阅读更多 »JMJD3 去甲基化酶及其抑制剂 GSK-J4 在前列腺癌细胞系中的作用,以及基因的调控。发布时间:2020 年 8 月摘要: Abstract not availabale 阅读更多 »PRAME 诱导葡萄膜黑色素瘤的基因组不稳定性 发表时间:12 月,-1 摘要:PRAME 是一种 CUL2 泛素连接酶亚基,通常在睾丸中表达,但在与非整倍性和转移相关的许多癌症类型中异常过度表达。在这里,我们表明PRAME isexpressed primarily in sperm...阅读更多»来自多中心研究的综合分析确定了神经胶质瘤的 RNA 甲基化相关 lncRNA 风险分层系统发表时间:12 月,-1 摘要:胃癌 (GC) 是全球癌症死亡的第四大原因。由于晚期胃癌缺乏有效的化疗方法,预后较差,免疫疗法的出现为胃癌治疗带来了新的希望。 Fur...阅读更多»核磷蛋白 1 与甲基转移酶 DOT1L 协同调节 H3K79me2 水平和 DNA 卫星在核仁异染色质周围的表达发表时间:12 月,-1 摘要:组蛋白甲基转移酶 DOT1L 催化 H3K79 的甲基化,它在哺乳动物中高度保守。 DOT1L 在细胞周期调节、DNA 修复、RNA 剪接和基因表达等多个生物过程中发挥功能性作用,...阅读更多 »CAZyome 中的基因组适应和植物的特殊代谢相关的 Streptomyces violaceusniger clade 发表时间:12 月,-1 摘要:链霉菌是革兰氏阳性放线菌,主要存在于植物根部微生物群中。根际链霉菌的存在所涉及的遗传决定因素大多是未知的,但可以依赖于释放植物的能力……阅读更多»